建筑行業三大體系認證是指：GB/T 50430工程建設施工組織質量管理體系認證、ISO 14001環境管理體系認證、ISO 45001職業健康安全管理體系認證。建筑行業三體系認證與普通三體系認證主要有以下不同：

1.認證內容：建筑行業三體系認證主要針對建筑行業的特定需求與質量管理、環境保護和職業健康有關標準的符合性。而普通三體系認證通常包括ISO 9001質量管理體系、ISO 14001環境管理體系和ISO 45001職業健康管理體系，適用于任何類型與規模的組織。

2.認證目的：建筑行業三體系認證主要是為了加強工程建設施工企業的質量管理工作，規范施工企業的工程投標、施工合同的簽訂、施工現場勘測、施工圖紙設計等一系列流程，提高建筑施工企業管理水平。而普通三體系認證則是為了使公司生產和服務提供過程更規范化，提升企業的競爭力，具有通用性。

3.標準依據：建筑行業三體系認證與普通三體系認證都是基于國家相關產品質量法、標準法和計量法等法規和產品標準（包含國標、行標和企標）為依據，但建筑行業還有更多的特定標準和規定，如必須符合GB/T 50430的有關標準。

4.風險考量：由于建筑行業容易出現重大安全事故和隱患，住建部加強了對工程建設施工企業的質量監管，這也是建筑行業三體系認證特別關注質量管理的原因之一。

總體來說，建筑行業三體系認證與普通三體系認證在認證內容、目的、標準依據和風險考量方面有所不同，但都是為了提高組織的管理水平和競爭力。